Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkp2Q9CQ73 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms