Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ46

Efcab2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab2Q9CQ46 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Efcab2Q9CQ46 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms