Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
StambpQ9CQ26 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms