Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nup155Q99P88 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nup155Q99P88 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms