Protein–RNA interactions for Protein: Q99NG0

Rad54l2, Helicase ARIP4, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54l2Q99NG0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rad54l2Q99NG0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rad54l2Q99NG0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms