Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
NsmfQ99NF2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms