Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atoh8Q99NA2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms