Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rnf17Q99MV7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rnf17Q99MV7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rnf17Q99MV7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rnf17Q99MV7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rnf17Q99MV7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rnf17Q99MV7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rnf17Q99MV7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rnf17Q99MV7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rnf17Q99MV7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Rnf17Q99MV7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms