Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PtprtQ99M80 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprtQ99M80 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
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