Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gins4Q99LZ3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms