Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms