Protein–RNA interactions for Protein: Q99LL3

Chst12, Carbohydrate sulfotransferase 12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst12Q99LL3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chst12Q99LL3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chst12Q99LL3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chst12Q99LL3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chst12Q99LL3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chst12Q99LL3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chst12Q99LL3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chst12Q99LL3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chst12Q99LL3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chst12Q99LL3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chst12Q99LL3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chst12Q99LL3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chst12Q99LL3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Chst12Q99LL3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chst12Q99LL3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chst12Q99LL3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chst12Q99LL3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chst12Q99LL3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chst12Q99LL3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chst12Q99LL3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chst12Q99LL3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chst12Q99LL3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chst12Q99LL3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chst12Q99LL3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Chst12Q99LL3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Chst12Q99LL3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chst12Q99LL3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms