Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nus1Q99LJ8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms