Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms