Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Clint1Q99KN9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms