Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim59Q922Y2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms