Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prpf3Q922U1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms