Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Clip1Q922J3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms