Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms