Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHS2

Crb1, Protein crumbs homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb1Q8VHS2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Crb1Q8VHS2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crb1Q8VHS2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crb1Q8VHS2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Crb1Q8VHS2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Crb1Q8VHS2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crb1Q8VHS2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Crb1Q8VHS2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crb1Q8VHS2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crb1Q8VHS2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crb1Q8VHS2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crb1Q8VHS2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crb1Q8VHS2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crb1Q8VHS2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crb1Q8VHS2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Crb1Q8VHS2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crb1Q8VHS2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crb1Q8VHS2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Crb1Q8VHS2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Crb1Q8VHS2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Crb1Q8VHS2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Crb1Q8VHS2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Crb1Q8VHS2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crb1Q8VHS2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crb1Q8VHS2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms