Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms