Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SnrkQ8VDU5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrkQ8VDU5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms