Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms