Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Colec12Q8K4Q8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Colec12Q8K4Q8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Colec12Q8K4Q8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Colec12Q8K4Q8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Colec12Q8K4Q8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Colec12Q8K4Q8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Colec12Q8K4Q8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Colec12Q8K4Q8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Colec12Q8K4Q8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Colec12Q8K4Q8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Colec12Q8K4Q8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Colec12Q8K4Q8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Colec12Q8K4Q8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Colec12Q8K4Q8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Colec12Q8K4Q8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Colec12Q8K4Q8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Colec12Q8K4Q8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Colec12Q8K4Q8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Colec12Q8K4Q8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Colec12Q8K4Q8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Colec12Q8K4Q8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Colec12Q8K4Q8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Colec12Q8K4Q8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Colec12Q8K4Q8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Colec12Q8K4Q8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Colec12Q8K4Q8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Colec12Q8K4Q8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Colec12Q8K4Q8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Colec12Q8K4Q8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Colec12Q8K4Q8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Colec12Q8K4Q8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms