Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Hecw1Q8K4P8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms