Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r72Q8K3N7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r72Q8K3N7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r72Q8K3N7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r72Q8K3N7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r72Q8K3N7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r72Q8K3N7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r72Q8K3N7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r72Q8K3N7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r72Q8K3N7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r72Q8K3N7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r72Q8K3N7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r72Q8K3N7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r72Q8K3N7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r72Q8K3N7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r72Q8K3N7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r72Q8K3N7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r72Q8K3N7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r72Q8K3N7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r72Q8K3N7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r72Q8K3N7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r72Q8K3N7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r72Q8K3N7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r72Q8K3N7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r72Q8K3N7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r72Q8K3N7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r72Q8K3N7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r72Q8K3N7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r72Q8K3N7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r72Q8K3N7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r72Q8K3N7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r72Q8K3N7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms