Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OptnQ8K3K8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms