Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Lrrtm1Q8K377 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Lrrtm1Q8K377 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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