Protein–RNA interactions for Protein: Q8K352

Sash3, SAM and SH3 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash3Q8K352 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sash3Q8K352 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sash3Q8K352 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms