Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Trappc12Q8K2L8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc12Q8K2L8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms