Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prkd3Q8K1Y2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms