Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alkbh3Q8K1E6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh3Q8K1E6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms