Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrit1Q8K099 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrit1Q8K099 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrit1Q8K099 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrit1Q8K099 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrit1Q8K099 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrit1Q8K099 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrit1Q8K099 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrit1Q8K099 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrit1Q8K099 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrit1Q8K099 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrit1Q8K099 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrit1Q8K099 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrit1Q8K099 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrit1Q8K099 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrit1Q8K099 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrit1Q8K099 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrit1Q8K099 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrit1Q8K099 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrit1Q8K099 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrit1Q8K099 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrit1Q8K099 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms