Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh2d5Q8JZW5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms