Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Setd1bQ8CFT2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Setd1bQ8CFT2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms