Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms