Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms