Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph6aQ8CDR2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms