Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lrrc9Q8CDN9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Lrrc9Q8CDN9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrrc9Q8CDN9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms