Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ufl1Q8CCJ3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ufl1Q8CCJ3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms