Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms