Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms