Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nhsl1Q8CAF4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nhsl1Q8CAF4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms