Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc159Q8C963 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms