Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms