Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
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Usp47Q8BY87 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
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