Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn17Q8BXA6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn17Q8BXA6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn17Q8BXA6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn17Q8BXA6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn17Q8BXA6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn17Q8BXA6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn17Q8BXA6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn17Q8BXA6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn17Q8BXA6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn17Q8BXA6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn17Q8BXA6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn17Q8BXA6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn17Q8BXA6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn17Q8BXA6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn17Q8BXA6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn17Q8BXA6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn17Q8BXA6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn17Q8BXA6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn17Q8BXA6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn17Q8BXA6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn17Q8BXA6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn17Q8BXA6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn17Q8BXA6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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Cldn17Q8BXA6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Cldn17Q8BXA6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Cldn17Q8BXA6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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