Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx1bQ8BX32 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx1bQ8BX32 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx1bQ8BX32 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx1bQ8BX32 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx1bQ8BX32 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx1bQ8BX32 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx1bQ8BX32 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx1bQ8BX32 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slx1bQ8BX32 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slx1bQ8BX32 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slx1bQ8BX32 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slx1bQ8BX32 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Slx1bQ8BX32 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slx1bQ8BX32 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slx1bQ8BX32 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slx1bQ8BX32 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slx1bQ8BX32 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Slx1bQ8BX32 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slx1bQ8BX32 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slx1bQ8BX32 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slx1bQ8BX32 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slx1bQ8BX32 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slx1bQ8BX32 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slx1bQ8BX32 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Slx1bQ8BX32 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slx1bQ8BX32 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms