Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp54Q8BL06 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp54Q8BL06 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms