Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tspan12Q8BKT6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms